Родился в семье крестьян Пензенской губернии. Учился в Наровчатской средней школе. В десять лет лишился родителей, жил у сестры отца. В 1928 году переехал в Ленинград. В 1939 году окончил филологический факультет ЛГУ. Первая научная публикация появилась в 1940. Участник Великой Отечественной войны. Воевал на Ленинградском фронте. Был трижды ранен. Владимир Иванович Малышев в середине 1930-х гг. начал сбор рукописей и старопечатных книг на Севере, став впоследствии одним из самых известных в России собирателей и хранителей литературных и исторических памятников.

В Институте русской литературы, где он заведовал рукописным отделом, создал Древлехранилище, в котором за 1949–1976 гг. он и его помощники собрали более 7 тыс. рукописей и старопечатных книг; наиболее представительными коллекциями в нем являлись печорская, карельская, пинежская, мезенская и северодвинская. В 1976 году Хранилищу древнерусских рукописей Пушкинского Дома присвоено имя его основателя – «Древлехранилище имени В. И. Малышева».

Начиная с 1950-х гг. регулярно информировал читателей «Псковской правды» о древних письменных памятниках, имевших отношение к Псковскому краю. Исследовал такое важнейшее произведение, являющееся историческим источником, как «Повесть о прихожении Стефана Батория на град Псков», текст которой с комментариями был подготовлен им в изданию Академией Наук СССР (1952 г.). Им же была написана статья об авторе «Повести», которым являлся изограф Василий.

В. И. Малышев пользовался большой популярностью в ученом мире. О нем издан роман («Владимир Иванович», опубликован в «Роман-газете») и множество воспоминаний, в том числе академиков Д. С. Лихачева и А. М. Панченко, в Пушкинском Доме ему посвящались «Малышевские чтения». Он неоднократно бывал в Пскове, работал с рукописями Древлехранилища Псковского музея, сотрудничал с его заведующим Л. А. Твороговым, ученым-филологом Е. А. Майминым и др.

Литература:

Маймин, Е. Исполнено любовью / Е. Маймин // Псковская правда. – 1994. – 13 окт.

У истоков Псковского краеведения : биобиблиографический рекомендательный указатель литературы. Вып. 10 / Гос. ком. Псков. обл. по культуре, ГБУК «Псков. обл. универс. науч. б-ка» ; [сост. Е. Г. Киселева, авт. ст. и предисл. А. В. Филимонов ; гл. ред. В. И. Павлова]. - Псков : Псковская областная универсальная научная библиотека, 2019. – С. 45-48.